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电子显微镜是一种使用电子显微镜技术观察物质微观结构的仪器，其工作原理是利用电磁透镜对电子进行聚焦和成像，电子显微镜有多种类型，包括透射电子显微镜、扫描电子显微镜、隧道扫描电子显微镜等，它们的差别主要在于观察方式和应用领域。
1、透射电子显微镜（TEM）主要观察样品的内部结构，需要制备薄切片样品，并且需要高真空环境，它的分辨率较高，能够提供较高的放大倍数，常用于材料科学、生物医学等领域。
2、扫描电子显微镜（SEM）主要观察样品的表面结构，其样品制备相对简单，能够提供三维立体感的图像，常用于材料、生物、医学、环境等领域。
3、隧道扫描电子显微镜（STEM）结合了SEM和TEM的特点，能够提供更高分辨率的图像，并且可以进行三维重构和原子尺度的分析，它常用于材料科学、纳米科技等高端领域。
在电子显微镜中，电子起到了至关重要的作用，电子显微镜的分辨本领比光学显微镜高得多，这主要是因为电子的波长比光子短，而且电子束的波长可以更容易地通过电磁场进行调控，电子的质量比光子大得多，因此它们在与物质相互作用时更容易受到物质的影响，从而可以提供更丰富的物质结构信息。
各种电子显微镜的差别主要体现在观察方式、样品制备、应用领域等方面，而电子在其中的作用是实现高分辨成像和物质结构分析的关键。